-functional dependency inference: applica- tion to DNA microarray expression data Découverte de -dépendances fonctionnelles : Application à l’analyse de l’expression des gènes

Nowadays, DNA microarray technology provides biologists with the ability to measure the expression levels of thousands of genes in a single experiment. As data from such experiments accumulates, it appears possible to attempt a reverse engineering of the underlying regulatory interactions from the expression data itself. This may be achieved by using sophisticate data mining techniques that have been successfully employed in the realm of database knowledge discovery. To this aim, we point out a new data mining problem, called -functional dependency inference problem. This problem is closely related to functional dependencies inference. Application of this ongoing work is illustrated on expression profiles from a sub-sample of genes from budding yeast Sacharomyces cerevisiae data and preliminary results are given. RÉSUMÉ. La technologie des biopuces (ou puces à ADN) permet désormais aux biologistes de mesurer les niveaux d’expression de milliers de gènes au cours d’une seule expérience. Grâce aux données recueillies, un enjeu majeur est d’élucider les mécanismes de régulation entre les gènes afin d’identifier de nouveaux médicaments potentiels. Or les techniques classiques de fouilles de données, utilisées dans le cadre de l’extraction de connaissances, peuvent aider à mieux comprendre ces mécanismes de régulation. Dans cet esprit, nous exhibons un nouveau problème de fouille de données, appelé découverte de -Dépendances Fonctionnelles. La méthode d’inférence est d’abord exposée puis une mise en oeuvre préliminaire est présentée pour l’analyse du profil d’expression d’un sous-ensemble de gènes de la levure Sacharomyces cerevisiae.